Es la colección que dio inicio a la creación de la Biblioteca Nacional en 1942. Tiene un total de 867 documentos nacionales e internacionales que abarcan los años de 1613 a 1899. Procede de la Biblioteca Colón, cuya inauguración data del 12 de octubre de 1892.

Donada por Baltazar Isaza Calderón en la década del 60. Cuenta con 1542 piezas que representan las distintas áreas del conocimiento humano, con énfasis en linguística y filosofía. Incluye obras de autores nacionales.

Fue donada en 1977 por el entonces canciller de la República Dr. Juan Antonio Tack. Consta de 415 volúmenes que comprenden las diferentes áreas del conocimiento humano, hace énfasis particular en el área de política mundial. Incluye obras de autores panameños.

Gran parte de las dos bibliotecas personales de Diógenes de la Rosa, fueron obsequiadas por sus hijos a la Biblioteca Nacional, en el mes de enero de 1998. Otra parte fue donada a la Biblioteca Interamericana Simón Bolívar de la Universidad de Panamá. Consta de 7 mil volúmenes que abarcan los más variados temas.

En vida, el arquitecto e intelectual panameño Ricardo J. Bemúdez donó su biblioteca personal a la Biblioteca Nacional.

Tres mil obras conforman esta colección que se caracteriza por su énfasis en la literatura, particularmente la latinoamericana. No obstante la literatura a nivel internacional también tiene sus rasgos en este acervo.

En el verano de 1998 la familia del Dr. Miguel Angel Martín donó este fondo, de valor para los estudiosos de la historia. Consta de 716 títulos que en su mayoría abordan temas de historia universal, historia de América, historia de Europa, historia de España, historia de Francia e historia de Panamá. También incluye material en torno a la civilización, los orígenes del hombre y su evolución y una gran cantidad de biografías de personajes ilustres en la historia universal.

Los libros de la colección se extienden desde 1926 hasta 1998. Incluye obras en español, inglés y francés.

Parte de la recopilación bibliográfica que acumuló en vida Rogelio Sinán permanece en la Biblioteca Nacional, otro tanto está en la Biblioteca de la Universidad de Panamá. Integran este fondo 799 obras escritas entre los años 1906 y 1993, de éstas 341 corresponden a la Sala Panameña. La colección casi en su totalidad está dedicada a temas literarios y asuntos nacionales.

En el catálogo en línea de la Biblioteca Nacional se pueden consultar los registros catalográficos de cada una de las piezas de la biblioteca personal de Ricardo J. Alfaro, la cual continúa siendo actualizada por la Fundación que lleva su nombre.

Esta colección posee un total de 2055 libros, cuyas fechas de publicación comprenden el período 1683 a 2000. Está especializada en temas como derecho internacional, lengua y literatura, relaciones de Panamá con los Estados Unidos, historia de Panamá e historia universal.

Este acervo del autor colombiano Héctor Orjuela fue traslado a la Bibloteca Nacional en el mes de julio de 2001 procedente de California, Estados Unidos. Está compuesto por 2000 ejemplares de libros y revistas editadas entre 1901 y 2000.

Contiene valiosas obras sobre literatura iberoamericana incluyendo todos los géneros: poesía, cuento, novela, teatro... Incluye una variedad de antologías y documentos sobre historia de la literatura latinoamericana.

La Biblioteca Nacional recibió en noviembre de 2001, por iniciativa de la Cervecería Nacional, el Documental de Música Folclórica Panameña; una colección (no comercial) de 85 discos compactos producto de sus investigaciones sobre etnomúsica de Panamá, que originalmente fueron grabadas en cintas magnetofónicas y ahora transferidas a formato digital.

El músico y diplomático panameño donó 1900 tomos de su biblioteca personal en el mes de abril de 2000. Abarca documentos de los años 1909 a 1999, de los cuales 354 son ejemplares correspondientes a la bibliografía nacional.

La colección es especializada en música, literatura latinoamericana, pintura y arte en general. Incluye además biografías y obras descriptivas de distintos países, sus monumentos, museos, teatros, etc.

La biblioteca personal del profesor Andrés Bolaños posee 538 títulos en su mayoría relativos a las ciencias sociales, específicamente sociología, trabajo social, sistemas políticos, desarrollo social latinoamericano, teoría del desarrollo económico, educación, metodología de investigación social. El período de edición de estas obras se extiende desde 1918 hasta 1997.

Esta colección fue trasladada a la Biblioteca Nacional en el año 2000. En total 2535 documentos forman parte de esta recopilación, de las cuales 2.357 son monografías y 178 publicaciones seriadas. De estos 2.115 documentos son monografías extranjeras y 242 documentos son monografías panameñas. De esta donación se rescató la colección completa de Boletines de la Academia Panameña de la Historia.

La Biblioteca Nacional “Ernesto J. Castillero R.” posee una colección de 543 títulos relacionados con la vida y obra de Simón Bolívar, editados entre los años 1866 y 1999.

La colección comprende iconografías, bibliografías, fotos de casas y parajes, correspondencia, monumentos a su memoria, homenajes póstumos. También incluye su biografía, los viajes y países que visitó, bases para la formación de su carácter, sus pensamientos y los sueños que tenía en relación con los países que liberó, sus maestros, la educación que recibió, la casa en la que nació y se crió, entre otros datos interesantes.

En octubre de 2001 el Centro de Estudios y Acción Social Panameño (CEASPA) trasladó a la Biblioteca Nacional un fondo de cinco mil libros, folletos y colecciones de revistas procedentes de su Centro de Documentación que funcionó desde los años 70 en la ciudad de Panamá. Anteriormente, en 1998 CEASPA donó su archivo vertical de 15 años de prensa panameña, debidamente seleccionado por sus investigadores sociales, organizados con su propio esquema de descriptores.

Un total de 1150 títulos de documentos panameños, principalmente contemporáneos, vinieron en esta dotación. Se destacan obras nacionales y extranjeras sobre el Canal de Panamá.
Las principales áreas temáticas que componen la colección son: sociología; género y sociedad con una apreciable cantidad de obras; relaciones laborales en Panamá y el exterior; política y economía y desarrollo en América Latina, haciendo énfasis sobre Centro América; protección del medio ambiente; y desarrollo de proyectos de asistencia social.

La colección de Don Ernesto de la Guardia que tenía sede en el Instituto Latinoamericano de Estudios Avanzados (ILDEA) fue donada a la Biblioteca Nacional el 28 de febrero de 2002. Consta de 1,564 títulos de publicaciones en un total de 7,238 ejemplares, entre los cuales se destacan 509 títulos de obras panameñas.

Los escritos del Dr. Harmodio Arias Madrid, fueron entregados a la Biblioteca Nacional por parte de su hija, Doña Rosario Arias de Galindo, el 18 de abril de 2002. Se trata de papeles y documentos del período en que fue Presidente de la República, comentarios personales y también manuscritos de su tesis elaborada en 1911, sobre el Canal de Panamá.

Esta colección fue donada personalmente por el Dr. Aquilino Boyd el 16 de marzo de 2002. Posee un total de 432 documentos relativos a la historia política de Panamá desde 1948 hasta 2001, incluyendo libros, mapas, recortes de periódicos, publicaciones seriadas y videocasettes. La colección vino acompañada de un fondo para costear las labores de catalogación y clasificación. Ya se encuentra a disposición del público y puede ser consultada a través del catálogo en línea.

Conjunto de 1069 planos arquitectónicos donados por el arquitecto mexicano Carlos Flores Marini al Gobierno Nacional en marzo de este año, como muestra de aprecio al pueblo panameño y para apoyar el rescate de los valores históricos del país. Los planos fueron confeccionados en la década del 70, producto del proyecto de reconstrucción del Casco Antiguo. Los planos abarcan las áreas de Portobelo, Panamá La Vieja y Casco Antiguo de la ciudad de Panamá.